ปุ๋ยอินทรีย์ไม่เพียงแต่เป็นปุ๋ยพื้นฐานในอุดมคติเท่านั้น แต่ยังเป็นปุ๋ยชั้นยอดอีกด้วย เป็นปุ๋ยหลักที่ให้สารอาหารในระหว่างการเจริญเติบโตของพืช เมื่อใช้ปุ๋ยอินทรีย์เป็นวัสดุตกแต่ง ควรมีข้อควรระวังต่อไปนี้:
1. การแสวงหาล่วงหน้า ปุ๋ยอินทรีย์มีสารอาหารแต่มีปริมาณจำกัด การปล่อยสารอาหารที่ปล่อยช้าจำนวนมากต้องใช้กระบวนการบางอย่าง และควรใช้ปุ๋ยอินทรีย์ล่วงหน้า 2-3 วัน
2. ใช้ปุ๋ยอินทรีย์คุณภาพสูง ในช่วงระยะเวลาการเจริญเติบโตอย่างรวดเร็วของพืช จำเป็นต้องมีสารอาหารจำนวนมาก เช่น ไนโตรเจนและโพแทสเซียม โดยทั่วไปปริมาณธาตุอาหารไนโตรเจนและโพแทสเซียมในปุ๋ยอินทรีย์ไม่สูงนัก เพื่อให้แน่ใจว่าความต้องการสารอาหารสำหรับการเจริญเติบโตของพืชอย่างรวดเร็ว ควรเลือกปุ๋ยอินทรีย์คุณภาพสูงที่มีปริมาณธาตุอาหารไนโตรเจนและโพแทสเซียมสูง
3. พัฒนาอัตราส่วนการจัดสรรที่เหมาะสมสำหรับปุ๋ยฐานและปุ๋ยตกแต่งหน้า เมื่ออุณหภูมิพื้นดินต่ำ กิจกรรมของจุลินทรีย์จะอ่อนแอ และการปล่อยสารอาหารของปุ๋ยอินทรีย์จะช้า ปริมาณการใช้ส่วนใหญ่สามารถใช้เป็นปุ๋ยพื้นฐานได้ เมื่ออุณหภูมิดินสูง จุลินทรีย์จะมีความสามารถในการย่อยสลายได้ดี หากปริมาณปุ๋ยพื้นฐานมากเกินไป ปุ๋ยจะถูกจุลินทรีย์ย่อยสลายมากเกินไปก่อนปลูก หลังจากปลูกแล้ว ผลของปุ๋ยจะเกิดขึ้นทันทีซึ่งบางครั้งอาจทำให้พืชโตเกินไป ดังนั้นการปลูกพืชภายใต้สภาวะที่มีอุณหภูมิสูงช่วยลดปริมาณการใส่ปุ๋ยพื้นฐานและเพิ่มปริมาณการเติมแต่งหน้า
4. การปลูกต้นกล้าควรทำในปริมาณที่พอเหมาะ ต้นกล้าพืชต้องการสารอาหารน้อย แต่สารอาหารไม่เพียงพอไม่สามารถสร้างต้นกล้าที่แข็งแรงได้ ซึ่งไม่เอื้อต่อการปลูกถ่ายและการเจริญเติบโตของพืชในอนาคต ปุ๋ยอินทรีย์แก่ซึ่งมีการปลดปล่อยสารอาหารสม่ำเสมอเป็นปุ๋ยในอุดมคติสำหรับการปลูกต้นกล้า โดยทั่วไปจะมีการเติมหญ้าคาร์บอน เวอร์มิคูไลต์ หรือเพอร์ไลต์จำนวนหนึ่งลงในปุ๋ยอินทรีย์หมัก และดินจะถูกผสมเท่าๆ กันเพื่อเป็นสารตั้งต้นของต้นกล้า ปริมาณปุ๋ยอินทรีย์ที่ใช้ไม่ควรเกิน 10% ของน้ำหนักรวมของธาตุอาหารในดิน
